SynRXN
Reaction Database for Benchmarking
파일 탐색기
- build_manifest.yml
- publish-package.yml
- test-and-lint.yml
- dependabot.yml
- brenda.csv.gz
- ecoli.csv.gz
- ehreact.csv.gz
- enzyme_map.csv.gz
- flower_c.csv.gz
- flower_e.csv.gz
- golden.csv.gz
- natcomm.csv.gz
- recon3d.csv.gz
- uspto_3k.csv.gz
- ecreact_1.json
- ecreact_2.json
- ecreact_3.json
- schneider_b_0.json
- schneider_u_0.json
- syntemp_0.json
- syntemp_1.json
- syntemp_2.json
- tpl_b_0.json
- tpl_u_0.json
- uspto_50k_b_0.json
- uspto_50k_u_0.json
- b97xd3_dh.json
- b97xd3_ea.json
- cycloadd_G_act.json
- cycloadd_G_r.json
- e2_ea.json
- e2sn2_ea.json
- lograte_lograte.json
- phosphatase_Conversion.json
- rad6re_dh.json
- rdb7_ea.json
- rgd1_ea.json
- sn2_ea.json
- snar_ea.json
- ecreact.csv.gz
- ehreact_activity.csv.gz
- schneider_b.csv.gz
- schneider_u.csv.gz
- syntemp.csv.gz
- tpl_b.csv.gz
- tpl_u.csv.gz
- uspto_50k_b.csv.gz
- uspto_50k_u.csv.gz
- b97xd3.csv.gz
- cycloadd.csv.gz
- e2.csv.gz
- e2sn2.csv.gz
- lograte.csv.gz
- phosphatase.csv.gz
- rad6re.csv.gz
- rdb7.csv.gz
- rgd1.csv.gz
- sn2.csv.gz
- snar.csv.gz
- complex.csv.gz
- mbs.csv.gz
- mnc.csv.gz
- mos.csv.gz
- classification_rows.csv
- property_rows.csv
- summary_classification.csv
- summary_prop.csv
- da.csv.gz
- uspto_500.csv.gz
- uspto_50k.csv.gz
- uspto_mit.csv.gz
- LICENSE
- metadata.yaml
- aam-ecoli.svg
- aam-enzyme_map.svg
- aam-golden.svg
- aam-natcomm.svg
- aam-recon3d.svg
- aam-uspto_3k.svg
- classification-ecreact.svg
- classification-schneider_b.svg
- classification-schneider_u.svg
- classification-syntemp.svg
- classification-tpl_b.svg
- classification-tpl_u.svg
- classification-uspto_50k_b.svg
- classification-uspto_50k_u.svg
- property-b97xd3.svg
- property-cycloadd.svg
- property-e2.svg
- property-e2sn2.svg
- property-lograte.svg
- property-phosphatase.svg
- property-rad6re.svg
- property-rdb7.svg
- property-rgd1.svg
- property-sn2.svg
- property-snar.svg
- rbl-complex.svg
- rbl-mbs.svg
- rbl-mnc.svg
- rbl-mos.svg
- synthesis-da.svg
- synthesis-uspto_500.svg
- synthesis-uspto_50k.svg
- synthesis-uspto_mit.svg
- .gitkeep
- aam-validator-comparison.json
- catalog-data.js
- catalog-data.json
- catalog.js
- custom.css
- query-benchmark.json
- synrxn-logo.svg
- synrxn-navbar.html
- synrxn-sidebar-section.html
- synrxn.png
- synrxn.svg
- synrxn.tex
- aam_validation.rst
- api.rst
- catalog.rst
- CHANGELOG_DOCS_UPDATE.md
- conf.py
- data_concept.rst
- data_records.rst
- getting_started.rst
- index.rst
- issues.rst
- make.bat
- Makefile
- paper.rst
- query_and_service.rst
- README.md
- reference.rst
- refs.bib
- requirements.txt
- tutorials_and_examples.rst
- whats_new.rst
- __init__.py
- aam.py
- rbl.py
- baseline.py
- benchmark_query_layer.py
- buid_da.py
- build_aam_dataset.py
- build_brenda_balanced.py
- build_classification_dataset.py
- build_ehreact.py
- build_enzyme_map.py
- build_flower_test.py
- build_property_dataset.py
- build_rbl_dataset.py
- build_synthesis_dataset.py
- compare_aam_validators.py
- __init__.py
- aam_validator.py
- io.py
- its_construction.py
- its_extraction.py
- mol_to_graph.py
- rules_extraction.py
- utils.py
- __init__.py
- classification.py
- property.py
- __init__.py
- butina.py
- ecfp.py
- wlfp.py
- __init__.py
- cache.py
- catalog.py
- constants.py
- data_loader.py
- github_client.py
- sources.py
- utils.py
- zenodo_client.py
- __init__.py
- io.py
- __init__.py
- synthesis.py
- template.py
- __init__.py
- repeated_group_aware_kfold.py
- repeated_kfold.py
- __init__.py
- assumptions.py
- auto_test.py
- common.py
- nonparametric.py
- parametric.py
- runner.py
- __init__.py
- __main__.py
- build_catalog.py
- build_manifest.py
- query.py
- service.py
- validate_data.py
- verify_manifest.py
- __init__.py
- test_butina.py
- test_ecfp.py
- test_wlfp.py
- __init__.py
- test_catalog.py
- test_data_loader.py
- test_github_client.py
- test_utils.py
- test_zenodo_client.py
- __init__.py
- test_repeated_group_aware.py
- test_repeated_kfold.py
- __init__.py
- test_assumptions.py
- test_common.py
- test_non_parametric.py
- test_parametric.py
- test_runner.py
- __init__.py
- test_aam_validator_compatibility.py
- test_catalog_ui.py
- test_cli.py
- test_manifest.py
- test_query.py
- test_service.py
- .dockerignore
- .flake8
- .gitignore
- .readthedocs.yml
- baseline.py
- build_doc.sh
- CITATION.cff
- Dockerfile.service
- example.ipynb
- LICENSE
- lint.sh
- manifest.json
- manifest.schema.json
- pyproject.toml
- pytest.sh
- README.md
- requirements.txt
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명령어 용어집
이 문서에서 사용된 명령어를 모아봤습니다. 낯선 명령어가 있다면 펼쳐서 확인해보세요.
git clone
설명 보기 ▼
git clone
Clone an existing repository.
git clone {{remote_repository_location}} {{path/to/directory}}
Clone an existing repository into a new directory (the default directory is the repository name):
git clone --recursive {{remote_repository_location}}
Clone an existing repository and its submodules:
git clone {{[-n|--no-checkout]}} {{remote_repository_location}}
Clone only the `.git` directory of an existing repository:
pip install
설명 보기 ▼
pip install
Install Python packages.
pip install {{package1 package2 ...}}
Install one or more packages:
pip install {{package1 package2 ...}} {{[-U|--upgrade]}}
Upgrade all specified packages to the latest version, installing any that are not already present:
pip install {{package}}=={{version}}
Install a specific version of a package:
python
설명 보기 ▼
python
Python 언어 인터프리터.
더 많은 정보: <https://docs.python.org/using/cmdline.html>.
python
REPL(대화형 셸) 시작:
python {{path/to/file.py}}
특정 Python 파일 실행:
python -i {{path/to/file.py}}
특정 Python 파일 실행 후 REPL 시작:
split
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split
파일을 여러 조각으로 분할.
더 많은 정보: <https://www.gnu.org/software/coreutils/manual/html_node/split-invocation.html>.
split {{[-l|--lines]}} 10 {{path/to/file}}
파일을 10줄씩 분할 (마지막 조각 제외):
split -l 10 {{path/to/file}}
파일을 각 조각이 10줄씩 되도록 분할 (마지막 조각 제외):
split {{[-n|--number]}} 5 {{path/to/file}}
파일을 5개의 파일로 분할. 각 조각이 동일한 크기를 갖도록 분할 (마지막 조각 제외):
