cmapR
Tools for manipulating annotated data matrices
파일 탐색기
최종 버전 다운로드 (.zip)- cdesc_char.RData
- ds.RData
- gene_set.RData
- kd_gct.RData
- Dockerfile
- nginx.conf
- available_modules.doctree
- build.doctree
- citing.doctree
- contributing.doctree
- data.doctree
- environment.pickle
- faq.doctree
- index.doctree
- io.doctree
- licenses.doctree
- utils.doctree
- available_modules.txt
- build.txt
- citing.txt
- contributing.txt
- data.txt
- faq.txt
- index.txt
- io.txt
- licenses.txt
- utils.txt
- badge_only.css
- theme.css
- fontawesome-webfont.eot
- fontawesome-webfont.svg
- fontawesome-webfont.ttf
- fontawesome-webfont.woff
- Inconsolata-Bold.ttf
- Inconsolata-Regular.ttf
- Lato-Bold.ttf
- Lato-Regular.ttf
- RobotoSlab-Bold.ttf
- RobotoSlab-Regular.ttf
- modernizr.min.js
- theme.js
- ajax-loader.gif
- basic.css
- comment-bright.png
- comment-close.png
- comment.png
- doctools.js
- down-pressed.png
- down.png
- file.png
- jquery-1.11.1.js
- jquery.js
- minus.png
- plus.png
- pygments.css
- searchtools.js
- underscore-1.3.1.js
- underscore.js
- up-pressed.png
- up.png
- websupport.js
- .buildinfo
- available_modules.html
- build.html
- citing.html
- contributing.html
- data.html
- faq.html
- genindex.html
- index.html
- io.html
- licenses.html
- objects.inv
- search.html
- searchindex.js
- utils.html
- available_modules.rst
- build.rst
- citing.rst
- conf.py
- contributing.rst
- data.rst
- faq.rst
- index.rst
- io.rst
- licenses.rst
- utils.rst
- Makefile
- example.lxb
- lm_epsilon_n978.grp
- lm_probes.gmx
- modzs_n25x50.gct
- modzs_n25x50.gctx
- query_up.gmt
- data.txt
- align_matrices.Rd
- annotate_gct.Rd
- append_dim.Rd
- cdesc_char.Rd
- check_colnames.Rd
- check_dups.Rd
- distil.Rd
- ds.Rd
- extract_gct.Rd
- fix_datatypes.Rd
- GCT-class.Rd
- GCT.Rd
- gene_set.Rd
- ids.Rd
- is.wholenumber.Rd
- kd_gct.Rd
- lxb2mat.Rd
- mat.Rd
- melt_gct.Rd
- merge_gct.Rd
- merge_with_precedence.Rd
- meta.Rd
- na_pad_matrix.Rd
- parse_gctx.Rd
- parse_gmt.Rd
- parse_gmx.Rd
- parse_grp.Rd
- process_ids.Rd
- rank_gct.Rd
- read_gctx_ids.Rd
- read_gctx_meta.Rd
- robust_zscore.Rd
- subset_gct.Rd
- subset_to_ids.Rd
- threshold.Rd
- transpose_gct.Rd
- update_gctx.Rd
- write_gct.Rd
- write_gctx.Rd
- write_gctx_meta.Rd
- write_gmt.Rd
- write_grp.Rd
- write_tbl.Rd
- data.R
- deprecated.R
- GCT.R
- io.R
- math.R
- utils.R
- arr3d.rds
- distil_result.rds
- extract.gct.res.rds
- matrices.rds
- rnorm20.rds
- rnorm_matrix.rds
- robust_zs_rnorm20.rds
- test_0.1_GCT.R
- test_0.2_io.R
- test_1_utils.R
- test_3_math.R
- test_cdesc.txt
- test_deprecated.R
- test_GCT_class.R
- test_n5x10.gct
- test_n5x10.gctx
- testthat.R
- tutorial.Rmd
- .dockerignore
- .gitignore
- DESCRIPTION
- install_cmapR.R
- LICENSE
- NAMESPACE
- NEWS
- README.md
# 설치 가이드
1. 코드 내려받기
git clone https://github.com/cmap/cmapR
깃허브에서 프로젝트 코드 전체를 내 컴퓨터로 내려받습니다.
cd cmapR
방금 내려받은 프로젝트 폴더 안으로 이동합니다.
2. Docker
쉬움 추천사전 준비물
- Git GitHub에서 프로젝트 코드를 내려받으려면 필요합니다.
- Docker Desktop 컨테이너를 빌드하고 실행하려면 필요합니다. 설치 후 실행해서 백그라운드에 켜두세요.
docker build -f docker/Dockerfile -t cmapr .
Dockerfile을 기반으로 실행 가능한 이미지를 빌드합니다.
docker run -p 8080:80 cmapr
빌드된 이미지를 실제 컨테이너로 실행합니다.
터미널에 docker compose ps 를 입력해 컨테이너들이 Up 상태인지 확인하세요. README에 포트 번호가 적혀있다면 브라우저에서 http://localhost:포트번호 로 접속해보세요.
// repository documentation
Was this content helpful?
(0 ratings)
