CNVpytor
a python extension of CNVnator -- a tool for CNV analysis from depth-of-coverage by mapped reads
파일 탐색기
최종 버전 다운로드 (.zip)- gc_chm13.pytor
- gc_chm13v1.1.pytor
- gc_chm13v2.0.pytor
- gc_hg19.pytor
- gc_hg38.pytor
- gc_kn99.pytor
- mask_hg19.pytor
- mask_hg38.pytor
- readme.txt
- cnvpytor.png
- CNVpytor.svg
- cnvpytor_640.png
- CNVpytor_v1.0.svg
- CNVpytor_v1.1.svg
- cnvpytor_w.png
- cnvpytor_w_640.png
- merging.png
- __init__.py
- __main__.py
- annotator.py
- bam.py
- export.py
- fasta.py
- genome.py
- io.py
- pool.py
- report.py
- root.py
- trio.py
- utils.py
- vcf.py
- version.py
- viewer.py
- viewparams.py
- bam.html
- export.html
- fasta.html
- genome.html
- index.html
- io.html
- pool.html
- root.html
- utils.html
- vcf.html
- version.html
- viewer.html
- viewparams.html
- AddReferenceGenome.md
- circular.md
- CNVpytor.ipynb
- Colab.ipynb
- compare.md
- JointCaller.md
- manhattan.md
- merging.md
- PythonLibraryGuide.ipynb
- region.md
- circular.png
- CNVpytor.stl
- compare.png
- joint.regions.0017.png
- joint_caller.png
- joint_caller_output.png
- joint_caller_plot_example.png
- manhattan.png
- merging.png
- region.png
- GettingStarted.md
- LICENSE
- README.md
- README.pypi.md
- requirements.txt
- setup.py
- setup_pypi.py
# 설치 가이드
1. 코드 내려받기
git clone https://github.com/abyzovlab/CNVpytor
깃허브에서 프로젝트 코드 전체를 내 컴퓨터로 내려받습니다.
cd CNVpytor
방금 내려받은 프로젝트 폴더 안으로 이동합니다.
2. 공식 설치 스크립트
쉬움 추천사전 준비물
- Python 3 pip 명령어를 쓰려면 Python이 필요합니다.
pip install git+https://github.com/abyzovlab/CNVpytor.git
PyPI에 배포된 패키지를 바로 설치합니다. 소스 클론이 필요 없습니다.
설치 후 새 터미널을 열고, 프로그램의 버전 확인 명령(예: --version)으로 정상 설치됐는지 확인하세요.
이 레포의 README에 적힌 실제 명령어를 그대로 가져왔습니다.
3. Python
쉬움사전 준비물
> pip install .
requirements.txt 등에 명시된 파이썬 라이브러리를 설치합니다.
pip install git+https://github.com/abyzovlab/CNVpytor.git
PyPI에 배포된 패키지를 바로 설치합니다. 소스 클론이 필요 없습니다.
> pip install --user .
requirements.txt 등에 명시된 파이썬 라이브러리를 설치합니다.
> pip install cnvpytor
requirements.txt 등에 명시된 파이썬 라이브러리를 설치합니다.
에러 메시지 없이 실행되고 터미널에 안내 문구가 출력되면 정상입니다.
이 레포의 README에 적힌 실제 명령어를 그대로 가져왔습니다.
// repository documentation
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