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Valise pédagogique pour la formation à R

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- [Parcours R - Supports pédagogiques pour la formation à R au sein du
  MTECT/MTE (et
  au-délà)](#parcours-r---supports-pédagogiques-pour-la-formation-à-r-au-sein-du-mtectmte-et-au-délà)
  - [Se former à R](#se-former-à-r)
  - [Contribuer](#contribuer)
  - [Modules de formations](#modules-de-formations)
    - [Formations déployées](#formations-déployées)
    - [Formations en construction](#formations-en-construction)
  - [Journal](#journal)

# Parcours R - Supports pédagogiques pour la formation à R au sein du MTECT/MTE (et au-délà)

## Se former à R

Ce dépôt contient les supports pédagogiques de la formation R en version
Rmd. Il permet aux référents R de construire et mettre à jour les
modules de formation. L’outil Github Action est utilisé pour compiler
les fichiers Rmd en support au format HTML. Ces supports sont ensuite
copiés sur la branche `gh-pages`.

## Contribuer

Si vous avez déjà configuré votre compte sspcloud pour contribuer,
cliquez simplement sur un lien de contribution. Sinon rendez-vous sur
[CONTRIBUTING.md](https://github.com/MTES-MCT/parcours-r/blob/master/CONTRIBUTING.md)

## Modules de formations

### Formations déployées

#### Module 1 : « Socle : Premier programme en R »

Lien vers le dépôt :
[parcours_r_socle_introduction](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_socle_introduction)

Statut : **Déployé**

[![Déploiement de
parcours_r_socle_introduction](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_socle_introduction/actions/workflows/rstudio-image-build.yml/badge.svg)](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_socle_introduction/actions/workflows/rstudio-image-build.yml)

[![](https://img.shields.io/badge/Formation_SSPCloud-ParcoursR_M1-blue)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M1»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_socle_introduction-4.6.0»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fformation%2Finit_script_formation.sh»)

[![](https://img.shields.io/badge/Contribution_SSPCloud-ParcoursR_M1-green)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M1_contrib»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_socle_introduction-4.6.0»&service.image.pullPolicy=«Always»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fcontribution%2Finit_script.sh»&init.personalInitArgs=«parcours_r_socle_introduction»&vault.secret=«parcours_r%2Ftokens»)

#### Module 2 : « Socle : Préparation des données »

Lien vers le dépôt :
[parcours_r_socle_preparation_des_donnees](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_socle_preparation_des_donnees)

Statut : **Déployé**

[![Déploiement de
parcours_r_socle_preparation_des_donnees](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_socle_preparation_des_donnees/actions/workflows/rstudio-image-build.yml/badge.svg)](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_socle_preparation_des_donnees/actions/workflows/rstudio-image-build.yml)

[![](https://img.shields.io/badge/Formation_SSPCloud-ParcoursR_M2-blue)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M2»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_socle_preparation_des_donnees-4.6.0»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fformation%2Finit_script_formation.sh»)

[![](https://img.shields.io/badge/Contribution_SSPCloud-ParcoursR_M2-green)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M2_contrib»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_socle_preparation_des_donnees-4.6.0»&service.image.pullPolicy=«Always»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fcontribution%2Finit_script.sh»&init.personalInitArgs=«parcours_r_socle_preparation_des_donnees»&vault.secret=«parcours_r%2Ftokens»)

#### Module 3 : « Statistiques descriptives »

Lien vers le dépôt :
[parcours_r_module_statistiques_descriptives](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_statistiques_descriptives)

Statut : **Déployé**

[![Déploiement de
parcours_r_module_statistiques_descriptives](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_statistiques_descriptives/actions/workflows/rstudio-image-build.yml/badge.svg)](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_statistiques_descriptives/actions/workflows/rstudio-image-build.yml)

[![](https://img.shields.io/badge/Formation_SSPCloud-ParcoursR_M3-blue)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M3»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_module_statistiques_descriptives-4.6.0»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fformation%2Finit_script_formation.sh»)

[![](https://img.shields.io/badge/Contribution_SSPCloud-ParcoursR_M3-green)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M3_contrib»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_module_statistiques_descriptives-4.6.0»&service.image.pullPolicy=«Always»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fcontribution%2Finit_script.sh»&init.personalInitArgs=«parcours_r_module_statistiques_descriptives»&vault.secret=«parcours_r%2Ftokens»)

#### Module 4 : « Analyse des données multi-dimensionnelles »

Lien vers le dépôt :
[parcours_r_module_analyse_multi_dimensionnelles](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_analyse_multi_dimensionnelles)

Statut : **Déployé**

[![Déploiement de
parcours_r_module_analyse_multi_dimensionnelles](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_analyse_multi_dimensionnelles/actions/workflows/rstudio-image-build.yml/badge.svg)](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_analyse_multi_dimensionnelles/actions/workflows/rstudio-image-build.yml)

[![](https://img.shields.io/badge/Formation_SSPCloud-ParcoursR_M4-blue)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M4»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_module_analyse_multi_dimensionnelles-4.6.0»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fformation%2Finit_script_formation.sh»)

[![](https://img.shields.io/badge/Contribution_SSPCloud-ParcoursR_M4-green)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M4_contrib»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_module_analyse_multi_dimensionnelles-4.6.0»&service.image.pullPolicy=«Always»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fcontribution%2Finit_script.sh»&init.personalInitArgs=«parcours_r_module_analyse_multi_dimensionnelles»&vault.secret=«parcours_r%2Ftokens»)

#### Module 5 : « Datavisualisation : produire des graphiques, des cartes et des tableaux »

Lien vers le dépôt :
[parcours_r_module_datavisualisation](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_datavisualisation)

Statut : **Déployé**

[![Déploiement de
parcours_r_module_datavisualisation](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_datavisualisation/actions/workflows/rstudio-image-build.yml/badge.svg)](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_datavisualisation/actions/workflows/rstudio-image-build.yml)

[![](https://img.shields.io/badge/Formation_SSPCloud-ParcoursR_M5-blue)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M5»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_module_datavisualisation-4.6.0»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fformation%2Finit_script_formation.sh»)

[![](https://img.shields.io/badge/Contribution_SSPCloud-ParcoursR_M5-green)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M5_contrib»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_module_datavisualisation-4.6.0»&service.image.pullPolicy=«Always»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fcontribution%2Finit_script.sh»&init.personalInitArgs=«parcours_r_module_datavisualisation»&vault.secret=«parcours_r%2Ftokens»)

#### Module 6 : « Publications reproductibles avec RMarkdown »

Lien vers le dépôt :
[parcours_r_module_publication_rmarkdown](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_publication_rmarkdown)

Statut : **Déployé**

[![Déploiement de
parcours_r_module_publication_rmarkdown](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_publication_rmarkdown/actions/workflows/rstudio-image-build.yml/badge.svg)](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_publication_rmarkdown/actions/workflows/rstudio-image-build.yml)

[![](https://img.shields.io/badge/Formation_SSPCloud-ParcoursR_M6-blue)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M6»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_module_publication_rmarkdown-4.6.0»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fformation%2Finit_script_formation.sh»)

[![](https://img.shields.io/badge/Contribution_SSPCloud-ParcoursR_M6-green)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M6_contrib»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_module_publication_rmarkdown-4.6.0»&service.image.pullPolicy=«Always»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fcontribution%2Finit_script.sh»&init.personalInitArgs=«parcours_r_module_publication_rmarkdown»&vault.secret=«parcours_r%2Ftokens»)

#### Module 7 : « Analyse spatiale »

Lien vers le dépôt :
[parcours_r_module_analyse_spatiale](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_analyse_spatiale)

Statut : **Déployé**

[![Déploiement de
parcours_r_module_analyse_spatiale](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_analyse_spatiale/actions/workflows/rstudio-image-build.yml/badge.svg)](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_analyse_spatiale/actions/workflows/rstudio-image-build.yml)

[![](https://img.shields.io/badge/Formation_SSPCloud-ParcoursR_M7-blue)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M7»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_module_analyse_spatiale-4.6.0»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fformation%2Finit_script_formation.sh»)

[![](https://img.shields.io/badge/Contribution_SSPCloud-ParcoursR_M7-green)](https://datalab.sspcloud.fr/launcher/ide/rstudio?autoLaunch=true&onyxia.friendlyName=«ParcoursR_M7_contrib»&service.image.custom.enabled=true&service.image.custom.version=«ghcr.io%2Fmtes-mct%2Fparcours_r_module_analyse_spatiale-4.6.0»&service.image.pullPolicy=«Always»&security.allowlist.enabled=false&init.personalInit=«https%3A%2F%2Fraw.githubusercontent.com%2FMTES-MCT%2Fparcours-r%2Fmaster%2Finit_scripts%2Fcontribution%2Finit_script.sh»&init.personalInitArgs=«parcours_r_module_analyse_spatiale»&vault.secret=«parcours_r%2Ftokens»)

### Formations en construction

#### Module 8 : « Big data et optimisation du code »

Lien vers le dépôt :
[parcours_r_module_big_data](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_big_data)

Statut : **En construction**

#### Module 9 : « Applications interactives avec Shiny »

Lien vers le dépôt :
[parcours_r_module_applications_shiny](https://github.com/MTES-MCT/parcours_r_module_applications_shiny)

Statut : **En construction**

## Journal

03/06/2026

- Mise à jour des github actions :
  - passage à pak au lieu de remotes pour l’installation des
    dépendances  
  - passage à ubuntu 24 et R 4.6.0 par défaut
  - utilisation d’un GITHUB_PAT fixe pour l’installation des dépendances
    dans les images Docker

28/05/2026

- Déploiement support Module 6

09/03/2026

- Ajout lien vers support Module 6

18/11/2025

- Mise à jour parties communes (Départ Caroline du groupe de référents)

26/12/2022

- Ménage de noël (suppression ancien scripts .sh…)

15/06/2022

- Ajout partie communes (présentation du parcours R)

28/11/2021

- ajout des liens de parcours de formations (sspcloud)

21/11/2021

- ajout vue d’ensemble des modules de formations (image docker et
  déploiement des modules)

09/12/2020

- ajout d’un repo pour chaque module de formation
- modification de la marianne

30/08/2019

- ajout d’un script pour ne compiler les modules dont les sources ont
  évolué
- ajout d’un répertoire front pour la page d’accueil (index.html) et les
  éléments associés

23/08/2019 \* optimisation de la création des supports : activation des
caches `knitr` et travis-ci

16/08/2019

- gérer la fermeture de rawgit : mise en place d’un branche `gh-pages`
  qui contient les supports HTML/PDF/ePub générés à partir des `Rmd`
- nettoyage de l’arborescence : suppression des fichiers de la branche
  `master` rendus inutiles

15/02/2019

- init (modules socle et à la carte : de 1 à 5)
- ajout d’une page index de présentation

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