MARBLE
Package for the data-driven representation of non-linear dynamics over manifolds based on a statistical distribution of local phase portrait features. Includes specific example on dynamical systems, synthetic- and real neural datasets.
파일 탐색기
최종 버전 다운로드 (.zip)- python-publish.yml
- run-tox.yml
- illustration_for_github.png
- conf.py
- dataloader.rst
- dynamics.rst
- geometry.rst
- index.rst
- layers.rst
- main.rst
- plotting.rst
- postprocessing.rst
- preprocessing.rst
- utils.rst
- index_readme.md
- Makefile
- README.md
- figure_54.html
- convert_spikes_to_firing_rates.py
- kinematic_decoding.ipynb
- macaque_reaching_helpers.py
- plot_MARBLE_representations.ipynb
- plot_vector_fields.ipynb
- README.md
- run_cebra.py
- run_marble.py
- sensitivity_analysis.ipynb
- workflow_and_comparison_of_MARBLE_and_CEBRA.ipynb
- decoding.ipynb
- multianimal_consistency.ipynb
- rat_utils.py
- README.md
- run_marble_and_cebra.ipynb
- sensitivity_analysis.ipynb
- __init__.py
- clustering.py
- dms.py
- helpers.py
- modules.py
- ranktwo.py
- RNN.ipynb
- ex_scalar_field_flat_surface.py
- ex_vector_field_curved_surface.py
- ex_vector_field_flat_surface.py
- vanderpol.ipynb
- __init__.py
- cknn.py
- ptu_dijkstra.pyx
- __init__.py
- dataloader.py
- default_params.yaml
- dynamics.py
- geometry.py
- layers.py
- main.py
- plotting.py
- postprocessing.py
- preprocessing.py
- smoothing.py
- utils.py
- __init__.py
- test_grad_kernel.py
- test_vector_diffusion.py
- .gitattributes
- .gitignore
- .pylintrc
- environment.yml
- environment_osx_arm.yml
- environment_osx_intel.yml
- environment_windows_native.yml
- install.sh
- LICENSE
- MANIFEST.in
- pyproject.toml
- README.md
- requirements_osx_arm.txt
- setup.py
- tox.ini
# 설치 가이드
1. 코드 내려받기
git clone https://github.com/Dynamics-of-Neural-Systems-Lab/MARBLE
깃허브에서 프로젝트 코드 전체를 내 컴퓨터로 내려받습니다.
cd MARBLE
방금 내려받은 프로젝트 폴더 안으로 이동합니다.
2. 공식 설치 스크립트
쉬움 추천사전 준비물
- Python 3 pip 명령어를 쓰려면 Python이 필요합니다.
pip install .
PyPI에 배포된 패키지를 바로 설치합니다. 소스 클론이 필요 없습니다.
설치 후 새 터미널을 열고, 프로그램의 버전 확인 명령(예: --version)으로 정상 설치됐는지 확인하세요.
이 레포의 README에 적힌 실제 명령어를 그대로 가져왔습니다.
3. Python
쉬움사전 준비물
pip install .
PyPI에 배포된 패키지를 바로 설치합니다. 소스 클론이 필요 없습니다.
`pip install -r requirements_osx_arm.txt`
requirements.txt 등에 명시된 파이썬 라이브러리를 설치합니다.
에러 메시지 없이 실행되고 터미널에 안내 문구가 출력되면 정상입니다.
이 레포의 README에 적힌 실제 명령어를 그대로 가져왔습니다.
4. Make
보통사전 준비물
- Git GitHub에서 프로젝트 코드를 내려받으려면 필요합니다.
- Make Linux/macOS는 보통 기본 설치되어 있습니다. Windows는 별도 설치(예: MSYS2, WSL)가 필요합니다.
cd doc
이 프로젝트의 관련 파일이 하위 폴더 안에 있어서, 먼저 그 폴더로 이동합니다.
make
생성된 빌드 설정을 바탕으로 실제 컴파일을 진행해 실행 파일을 만듭니다.
에러 없이 끝나면 성공입니다. 생성된 실행 파일을 직접 실행해보세요.
// repository documentation
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