MetaTrass
Metagenomics Taxonomic Reads Assembly Single-Species
파일 탐색기
- run.sh
- Trass.py
- barcode_list.txt
- lane.lst
- imt2.46.jpg
- .DS_Store
- AP.py
- ContigPurify.py
- GC.py
- GetCleandata.py
- Kraken2Taxon.py
- MetaAssembly.py
- ReadID2Fastq.py
- SplitBarcode.py
- TB.py
- ToolConfig.py
- TXACBrefiner.py
- VERSION
- run.log
- stp1.1.splitbarcode.sh
- stp1.2.getcleandata.sh
- stp2.1.kraken2taxon.sh
- stp2.2.TXACBrefiner.sh
- stp2.3.ReadID2Fastq.sh
- stp3.1.MetaAssembly.sh
- stp3.2.ContigPurify.sh
- split_reads.1.fq.gz.clean.gz
- split_reads.2.fq.gz.clean.gz
- 5X.id_17.allbarcode.txt_list_1.fq.gz
- 5X.id_17.allbarcode.txt_list_2.fq.gz
- Demo.R
- 5X.id_17.allbarcode.txt
- 5X.id_17.allread.txt
- others.ids.txt
- tax_id.17.info.txt
- tax_reads_depth.txt
- .DS_Store
- 17.fa
- all_alignments_17_scaffold.tsv
- report.txt
- .DS_Store
- 17_supernova_result.fasta.gz
- _err
- _log
- barcode_clean_freq.txt
- fake_10X.err
- fake_10X.log
- merge.txt
- merge_barcode.err
- merge_barcode.log
- .DS_Store
- .DS_Store
- .DS_Store
- README.md
- fake_10x.pl
- merge_barcodes.pl
- shell_barcode
- stlfr2supernova.py
- .DS_Store
- contig_purify.py
- fa_split_by_taxid.py
- kraken2
- python3
- quast.py
- ref_genome_size.py
- seqtk
- SOAPfilter_v2.2
- split_barcode.pl
- supernova
- TABrefiner
- TABrefiner.cpp
- TABrefiner.NOS
- TABrefiner.NOS.cpp
- TABrefiner2
- .DS_Store
- .gitattributes
- LICENSE
- README.md
- run.sh
- Trass.py
- VERSION
# CDN으로 사용하기
jsDelivrjsDelivr는 공개 GitHub 리포지토리를 별도 설정 없이 CDN으로 즉시 서빙합니다. 버전과 파일을 고르면 웹페이지에 바로 붙일 수 있는 링크와 예시 코드가 만들어집니다.
명령어 용어집
이 문서에서 사용된 명령어를 모아봤습니다. 낯선 명령어가 있다면 펼쳐서 확인해보세요.
git clone
설명 보기 ▼
git clone
Clone an existing repository.
git clone {{remote_repository_location}} {{path/to/directory}}
Clone an existing repository into a new directory (the default directory is the repository name):
git clone --recursive {{remote_repository_location}}
Clone an existing repository and its submodules:
git clone {{[-n|--no-checkout]}} {{remote_repository_location}}
Clone only the `.git` directory of an existing repository:
python
설명 보기 ▼
python
Python 언어 인터프리터.
더 많은 정보: <https://docs.python.org/using/cmdline.html>.
python
REPL(대화형 셸) 시작:
python {{path/to/file.py}}
특정 Python 파일 실행:
python -i {{path/to/file.py}}
특정 Python 파일 실행 후 REPL 시작:
python3
설명 보기 ▼
python3
이 명령은 `python`의 별칭입니다.
tldr python
자세한 내용은 원본 명령을 참고하세요:
