smudgeplot
Inference of ploidy and heterozygosity structure using whole genome sequencing data
파일 탐색기
최종 버전 다운로드 (.zip)- a-bug.md
- feature-request.md
- smudgeplot-inference-problem.md
- smudgeplot-interpretation.md
- build.yml
- publish.yml
- alternative_plot_covA_covB.R
- alternative_plotting.R
- alternative_plotting_functions.R
- alternative_plotting_testing.R
- pair_clustering.py
- README.md
- BGA_tutorial.md
- DEVELOPMENT.md
- interactive_plot_strawberry_full_kmer_families_fooling_around.R
- more_away_pairs.py
- playground.py
- playground.R
- popart.R
- gene_core.c
- gene_core.h
- libfastk.c
- libfastk.h
- matrix.c
- matrix.h
- PloidyList.c
- PloidyPlot.c
- __init__.py
- cli.py
- smudgeplot.py
- README.md
- run_smudge_version.sh
- .gitignore
- LICENSE.md
- Makefile
- MANIFEST.in
- pyproject.toml
- README.md
- setup.py
# 설치 가이드
1. 코드 내려받기
git clone https://github.com/KamilSJaron/smudgeplot
깃허브에서 프로젝트 코드 전체를 내 컴퓨터로 내려받습니다.
cd smudgeplot
방금 내려받은 프로젝트 폴더 안으로 이동합니다.
2. 공식 설치 스크립트
쉬움 추천사전 준비물
- Python 3 pip 명령어를 쓰려면 Python이 필요합니다.
pip install smudgeplot
PyPI에 배포된 패키지를 바로 설치합니다. 소스 클론이 필요 없습니다.
설치 후 새 터미널을 열고, 프로그램의 버전 확인 명령(예: --version)으로 정상 설치됐는지 확인하세요.
이 레포의 README에 적힌 실제 명령어를 그대로 가져왔습니다.
3. Python
쉬움사전 준비물
conda install pip
이 명령어를 터미널에 그대로 입력해 실행하세요.
pip install smudgeplot
PyPI에 배포된 패키지를 바로 설치합니다. 소스 클론이 필요 없습니다.
cd smudgeplot && pip install .
방금 내려받은 프로젝트 폴더 안으로 이동합니다.
에러 메시지 없이 실행되고 터미널에 안내 문구가 출력되면 정상입니다.
이 레포의 README에 적힌 실제 명령어를 그대로 가져왔습니다.
4. Make
보통사전 준비물
- Git GitHub에서 프로젝트 코드를 내려받으려면 필요합니다.
- Make Linux/macOS는 보통 기본 설치되어 있습니다. Windows는 별도 설치(예: MSYS2, WSL)가 필요합니다.
make
생성된 빌드 설정을 바탕으로 실제 컴파일을 진행해 실행 파일을 만듭니다.
에러 없이 끝나면 성공입니다. 생성된 실행 파일을 직접 실행해보세요.
이 레포의 README에 적힌 실제 명령어를 그대로 가져왔습니다.
// repository documentation
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